對於高爾夫球場的問題來說，行政院農業委員會在所有相關部會 主管單位中，是主管球場水土保持、使用林地、農地及農藥等相關事 項。是有關國土保安最重要的部份。然而，農委會卻一再對高爾夫球 場問題再三放水。在去年十月十三日行政院會的輿情報告中，對超挖 的部分先放了一次水：孫主委曾表示，超挖私有的農牧用地，在不違 反水土保持原則下，允許若干農牧用地做休閒用，希望以此原則解決 問題。但對超挖的面積，到底可以超挖多少？而這些超挖的土地，地 目變更的問題是農委會要解決嗎？有關農藥的部分，請問農委會做了幾次偵測？有幾家合格？
去年十一月二日，農委會在討論高爾夫球場超挖問題時，竟反對 由林業處所提從重處分的提案。今年二月十三日行政院政務會談中， 孫主委表示：超挖林地要就地恢復恐怕無法完全做到，不過可以要求 該球場在相同的面積的前提下，要求其補造林。這種說詞在表面上好 像十分合理，但是實際上卻是令人啼笑皆非。在河流的上游和下游的 地，對水土保持的作用是一樣的嗎？在坡度不同的林地，對水土保持 的作用也是一樣的嗎？怎麼可以說在「相同面積」的前提下補造林就 可以了？而且，什麼叫做「前提」？是什麼樣的「前提」？
今年二月十四日，民進黨中央黨部社會運動部，利用農委會所提 供的資料，指出三十家違法超挖的高爾夫球場，共計超挖了九百二十 一點八公頃的土地，這樣大面積的土地，至少可以種三百萬棵樹。可 見農委會手中握有許多高爾夫球場違法的證據，可是，卻不積極法辦 。就農委會手中至少掌握了三十四家球場違法的證據，但農委會選擇 了最輕的處罰方式。老球場要讓它就地合法，其他的球場只要不是佔 用國有地，都好商量，超挖林地要以森林法處理，最重的不過是罰款 九千元。農牧用地呢？農委會並沒有法可罰。
農委會是否只能如此處理呢？答案當然是否定的。超挖林地可以 引用山坡地保育利用條例，要業者限期改正，重新造林，超挖面積在 兩公頃以下者，須在一年內完成造林，兩公頃以上者，須在三年內完 成造林。超挖農牧用地，可以移請內政部依區域計劃法強制拆除建物 ，要求恢復原狀。依高爾夫球場管理規則第十條，對高爾夫球場違法 情節嚴重者，並得通知教育部撤銷其籌設或開放許可。農委會手中握 有如此多高爾夫球場違法的證據，卻不辦或輕辦；對違法情節嚴重者 ，又不通知教育部撤銷其籌設或開放許可。可見農委會嚴重失職，孫 主委做不好，乾脆自請處分，下臺算了。
據農政單位統計，自今年一月至今，約有九十二萬隻雞死於新城 雞瘟。事實上，早在今年二月起，國際畜疫協會（ＯＩＥ）已將臺灣 列為「新城雞瘟疫區」，不淮我國與國際雞肉市場往來。在消息傳出 後，民眾恐慌，雞肉乏人問津，雞農的收入一落千丈。比較之下，新城雞瘟比雞瘟病情要來得輕微。新城雞瘟是急性、 高傳染性、高死亡性的全身性感染疾病。凡是未曾注射疫苗的禽類動 物，都無法倖免於這種病毒的威脅。雞瘟為一種流行性感冒，不管是 家禽、鳥類或水禽，一旦感染這個疾病，呼吸、消化和神經系統會立 即受到破壞，死亡率高達八○﹪以上，而且，病毒還會迅速蔓延開來 。更嚴重的是，雞瘟的病毒基因還可能變化成另外一種流行性感置病 毒，殃及人體。
現在因為農委會發出此項訊息後，又沒有向民眾澄清，也沒有向 民眾說明死雞和活宰的雞肉要如何分辨。造成民眾恐慌，雞肉乏人問 津，雞農的收入一落千丈。現成逼得雞農不得已要抗爭，請問農委會 有何解決之道？在大量的雞隻或家畜死亡後，常常見到棄屍在河邊， 造成惡臭、環境污染，和形成傳染病毒滋生的溫床，農委會碰到這種 狀況要如何處理？有沒有興建大型的焚化爐來集中處理的計劃？
國民黨在三月九日的院會中，動員表決擱置了農保條例修正案及 其中的老農津貼條款。然而，今日農委會卻又研擬出和民進黨老農津 貼內容大同小異的「老年農民福利金暫行條例」草案，每年依農委會 的統計資料顯示，財政支出也高達一百○五億元。國民黨竟然要提出 這麼與老農津貼雷同的「老年農民福利金暫行條例」草案，何不在院 會中讓農保條例三讀通過算了？說穿了是要將老農津貼的功勞由民進 黨手中搶走變成國民黨的功勞罷了。更惡劣的說法，就是想將老農津 貼延後實施，並破壞全民保險的完整性，還敢美名為雙軌制，請問農 委會孫主委，事實是否是如此呢？